Glossaire de la recherche sur les peptides
Les termes des certificats, des pages produit et de la littérature, expliqués simplement, avec des liens vers les explications détaillées.
Les termes qui apparaissent sur les certificats d’analyse, les pages produit et dans la littérature de recherche, expliqués simplement. Lorsqu’un terme a un article dédié, le lien suit la définition.
A–C
Acétylation (N-terminale) — fixation d’un groupe acétyle sur l’amine libre du N-terminal, bloquant les aminopeptidases. Notée Ac- en début de séquence.
Agrégation — association irréversible de molécules peptidiques entre elles, favorisée par les interfaces air-liquide, les cycles de congélation-décongélation, une forte concentration et un pH proche du point isoélectrique. Non réversible par dilution. Article complet.
Aib — acide α-aminoisobutyrique, acide aminé non protéinogène portant deux groupes méthyle sur le carbone alpha. Crée un encombrement bloquant le clivage par la DPP-4 et favorise la structure hélicoïdale. Utilisé dans le GLP-III, le GLP-III et l’ipamoréline.
Amidation (C-terminale) — conversion de l’acide carboxylique terminal en amide, bloquant les carboxypeptidases. Notée -NH2.
Contre-ion — ion de charge opposée associé aux groupes chargés d’un peptide, généralement le trifluoroacétate. Représente 5 à 20 % de la masse du flacon. Article complet.
COA — certificat d’analyse. Document rapportant les résultats analytiques d’un lot donné. Significatif seulement si le numéro de lot correspond au flacon. Article complet.
D–H
Désamidation — conversion spontanée des chaînes latérales d’asparagine ou de glutamine en aspartate ou glutamate, ajoutant 1 Da. Accélérée au-dessus de pH 7.
DPP-4 — dipeptidyl peptidase-4, enzyme retirant les deux premiers résidus N-terminaux des peptides sensibles. Principale voie d’élimination des peptides incrétines et GHRH, et cible de l’essentiel de l’ingénierie de la demi-vie.
Eau bactériostatique — eau stérile contenant 0,9 % d’alcool benzylique comme conservateur, permettant des prélèvements répétés sur plusieurs semaines. Cytotoxique ; inadaptée à la culture cellulaire. Article complet.
Endotoxine — lipopolysaccharide des membranes de bactéries à Gram négatif. Thermostable, invisible en HPLC, active au picogramme en travail cellulaire. Mesurée en EU/mg. Article complet.
ESI — ionisation par électronébulisation, méthode de spectrométrie de masse produisant des ions multichargés et se couplant directement à la HPLC. Article complet.
Fmoc — fluorénylméthyloxycarbonyle, groupe protecteur labile en milieu basique de la stratégie dominante de synthèse en phase solide.
GHS-R1a — récepteur des sécrétagogues de l’hormone de croissance, cible de la ghréline et de la classe GHRP. Distinct du récepteur de la GHRH. Article complet.
HPLC — chromatographie liquide haute performance. Sépare par hydrophobicité et donne la pureté en pourcentage d’aire. Article complet.
I–P
Demi-vie (t½) — temps nécessaire pour que la concentration plasmatique diminue de moitié. Différente de la durée d’effet. Article complet.
Lot — matériel produit en une seule campagne dans un même jeu de conditions. Les résultats d’analyse valent pour le lot testé et pour aucun autre. Article complet.
Lyophilisation — séchage par sublimation sous vide, laissant un solide vitreux. Raison pour laquelle un peptide scellé est stable à température ambiante. Article complet.
MALDI — désorption-ionisation laser assistée par matrice. Produit des ions majoritairement monochargés ; tolère les sels.
Norleucine (Nle) — analogue de la méthionine sans soufre, utilisé pour supprimer l’oxydation. Présente dans le Melanotan II.
Point isoélectrique (pI) — pH auquel un peptide ne porte aucune charge nette et la solubilité est minimale. La plupart des échecs de dissolution sont un peptide à son pI. Article complet.
Pont lactame — liaison amide covalente entre deux chaînes latérales, cyclisant un peptide. Plus stable qu’un disulfure : ne se réarrange pas et ne se réduit pas. Signature de masse −18 Da.
Pureté (HPLC, % d’aire) — aire du pic principal divisée par l’aire totale intégrée. Relative, non absolue : ne dit rien des contre-ions ni de l’eau.
R–Z
Réarrangement — un pont disulfure qui change de partenaire et donne un isomère de même masse et de structure fausse. Indétectable par spectrométrie de masse. Article complet.
Reconstitution — dissolution d’un peptide lyophilisé dans un solvant. Article complet.
Séquence de délétion — chaîne à laquelle il manque un résidu, produite par un couplage incomplet. Classe d’impuretés dominante des peptides synthétiques, assez proche du produit pour être difficile à séparer.
SPPS — synthèse peptidique en phase solide. Les chaînes sont construites sur une résine insoluble, à partir du C-terminal. Article complet.
Teneur en peptide — fraction de la masse du flacon qui est réellement du peptide, typiquement 75–90 %. Question différente de la pureté. Article complet.
TFA — acide trifluoroacétique. Utilisé au clivage et comme additif de phase mobile HPLC ; contre-ion par défaut d’un peptide purifié conventionnellement. Cytotoxique à concentration suffisante.
Usage recherche uniquement — une position réglementaire, non une clause de non-responsabilité. Le droit de l’UE classe par destination : un produit chimique de recherche relève de REACH et CLP, non du régime du médicament. Article complet.
Masse théorique vs observée — masse calculée depuis la séquence contre masse mesurée. La concordance confirme l’identité ; les écarts fréquents sont +16 (oxydation), +1 (acide libre ou désamidation), −18 (perte d’eau) et −57 à −186 (une délétion).
All products and information referenced are for in-vitro research and laboratory use only. Nothing here is medical advice, and no therapeutic claim is made or implied.