Słownik badań nad peptydami
Terminy z certyfikatów analizy, kart produktów i literatury badawczej, wyjaśnione wprost — od acetylacji po masę teoretyczną.
Terminy pojawiające się na certyfikatach analizy, kartach produktów i w literaturze badawczej, wyjaśnione wprost. Tam, gdzie za terminem stoi dłuższy artykuł, odnośnik następuje po definicji.
A–C
Acetylacja (końca N) — przyłączenie grupy acetylowej do wolnej aminy na końcu N peptydu, blokujące atak aminopeptydaz. Zapisywana jako Ac- na początku sekwencji.
Agregacja — nieodwracalne łączenie się cząsteczek peptydu ze sobą, napędzane granicami faz powietrze–ciecz, cyklami zamrażania i rozmrażania, wysokim stężeniem oraz pH bliskim punktu izoelektrycznego. Nie odwraca jej rozcieńczenie. Pełny artykuł.
Aib — kwas α-aminoizomasłowy, aminokwas niebiałkowy z dwiema grupami metylowymi przy węglu alfa. Dodaje zawadę przestrzenną blokującą cięcie przez DPP-4 i sprzyja strukturze helikalnej. Używany w GLP-III i ipamorelinie.
Amidacja (końca C) — przekształcenie końcowego kwasu karboksylowego w amid, blokujące atak karboksypeptydaz. Zapisywana jako -NH2.
COA — certyfikat analizy. Dokument podający wyniki analityczne konkretnej szarży. Ma znaczenie tylko wtedy, gdy numer szarży zgadza się z fiolką. Pełny artykuł.
Czystość (HPLC, % powierzchni) — powierzchnia piku głównego podzielona przez łączną scałkowaną powierzchnię pików. Względna, nie bezwzględna: nie mówi nic o przeciwjonach ani o wodzie.
D–H
Deamidacja — samorzutne przekształcenie łańcuchów bocznych asparaginy lub glutaminy w asparaginian lub glutaminian, dodające 1 Da. Przyspieszona powyżej pH 7.
DPP-4 — dipeptydylopeptydaza-4, enzym usuwający dwie pierwsze reszty od końca N podatnych peptydów. Główna droga eliminacji peptydów inkretynowych i GHRH oraz cel większości działań inżynierii okresu półtrwania.
Endotoksyna — lipopolisacharyd z błon bakterii Gram-ujemnych. Termostabilny, niewidoczny dla HPLC, aktywny w pracy komórkowej na poziomie pikogramów. Mierzony w EU/mg. Pełny artykuł.
ESI — jonizacja przez elektrorozpylanie, metoda spektrometrii mas dająca jony wielokrotnie naładowane i sprzęgająca się bezpośrednio z HPLC. Pełny artykuł.
Fmoc — fluorenylometyloksykarbonyl, labilna w środowisku zasadowym grupa ochronna używana w dominującej strategii syntezy na fazie stałej.
GHS-R1a — receptor sekretagogów hormonu wzrostu, cel greliny i klasy GHRP. Odrębny od receptora GHRH. Pełny artykuł.
HPLC — wysokosprawna chromatografia cieczowa. Rozdziela według hydrofobowości i podaje czystość jako procent powierzchni. Pełny artykuł.
I–P
Liofilizacja — suszenie sublimacyjne. Usuwa wodę przez sublimację pod próżnią, zostawiając szkliste ciało stałe. Powód, dla którego szczelnie zamknięty peptyd jest stabilny w temperaturze otoczenia. Pełny artykuł.
MALDI — desorpcja/jonizacja laserowa wspomagana matrycą. Daje głównie jony jednokrotnie naładowane; tolerancyjna wobec soli.
Mostek laktamowy — kowalencyjne wiązanie amidowe między dwoma łańcuchami bocznymi, cyklizujące peptyd. Stabilniejszy od mostka dwusiarczkowego: nie miesza się i nie redukuje. Sygnatura masowa −18 Da.
Norleucyna (Nle) — analog metioniny bez siarki, używany do wyeliminowania utleniania. Występuje w Melanotanie II.
Przeciwjon — jon o przeciwnym ładunku związany z naładowanymi grupami peptydu, zwykle trifluorooctan. Odpowiada za 5–20 procent masy fiolki. Pełny artykuł.
Punkt izoelektryczny (pI) — pH, przy którym peptyd nie ma ładunku wypadkowego, a rozpuszczalność osiąga minimum. Większość niepowodzeń rozpuszczania to peptyd siedzący w swoim pI. Pełny artykuł.
R–Z
Rekonstytucja — rozpuszczenie liofilizowanego peptydu w rozpuszczalniku. Pełny artykuł.
Sekwencja delecyjna — łańcuch, w którym brakuje jednej reszty, powstający, gdy krok sprzęgania jest niekompletny. Dominująca klasa zanieczyszczeń w peptydach syntetycznych, strukturalnie na tyle bliska produktowi, że trudna do oddzielenia.
SPPS — synteza peptydów na fazie stałej. Łańcuchy buduje się na nierozpuszczalnej żywicy, począwszy od końca C. Pełny artykuł.
Szarża (partia) — materiał wytworzony w jednym cyklu produkcyjnym w jednym zestawie warunków. Wyniki analityczne dotyczą badanej szarży i żadnej innej. Pełny artykuł.
TFA — kwas trifluorooctowy. Używany przy odcinaniu z żywicy i jako dodatek do fazy ruchomej HPLC; domyślny przeciwjon peptydu oczyszczanego konwencjonalnie. Cytotoksyczny przy odpowiednim stężeniu.
Wyłącznie do celów badawczych — stanowisko regulacyjne, a nie zastrzeżenie prawne. Prawo UE klasyfikuje według przeznaczenia, więc chemikalium badawcze podlega REACH i CLP, a nie przepisom o produktach leczniczych. Pełny artykuł.
Woda bakteriostatyczna — woda sterylna zawierająca 0,9 procent alkoholu benzylowego jako konserwantu, pozwalająca na wielokrotny dostęp do fiolki przez tygodnie. Cytotoksyczna; nieodpowiednia do hodowli komórkowej. Pełny artykuł.
Zamiana mostków (scrambling) — mostek dwusiarczkowy zmieniający partnerów, dający izomer o identycznej masie i błędnej strukturze. Niewykrywalny spektrometrią mas. Pełny artykuł.
Zawartość peptydu — ułamek masy fiolki będący faktycznie peptydem, zwykle 75–90 procent. To inne pytanie niż czystość. Pełny artykuł.
Okres półtrwania (t½) — czas, w którym stężenie w osoczu spada o połowę. To nie to samo co czas działania. Pełny artykuł.
Masa teoretyczna a zmierzona — masa obliczona z sekwencji wobec masy zmierzonej. Zgodność potwierdza tożsamość; częste rozbieżności to +16 (utlenianie), +1 (wolny kwas lub deamidacja), −18 (utrata wody) oraz −57 do −186 (delecja).
All products and information referenced are for in-vitro research and laboratory use only. Nothing here is medical advice, and no therapeutic claim is made or implied.