Ce que « 5 mg » signifie réellement sur un flacon de peptide
L'étiquette indique la masse brute de lyophilisat. Contre-ions et eau résiduelle en font partie, et le calcul vaut la peine d'être fait une fois.
Un flacon étiqueté 5 mg ne contient pas 5 mg de peptide. Ce n’est ni un tour de passe-passe ni une particularité d’un fournisseur — c’est une conséquence de la façon dont les peptides sont fabriqués et les flacons remplis, et le calcul vaut la peine d’être fait une fois.
À quoi renvoie le chiffre de l’étiquette
La quantité indiquée est la masse brute de lyophilisat — la masse totale de solide dans le flacon. Ce solide n’est pas du peptide pur. Il contient, par ordre décroissant :
- Le peptide lui-même
- Des contre-ions, généralement du trifluoroacétate issu de la purification. Typiquement 5 à 20 % en masse, croissant avec le nombre de résidus basiques de la séquence
- De l’eau résiduelle, quelques pour cent même après un séchage soigné
- Des traces de solvant résiduel
La fraction qui est réellement du peptide s’appelle la teneur en peptide, et pour un peptide de recherche typique elle se situe entre 75 et 90 pour cent.
Le calcul
Prenons un flacon de 5 mg à 99 % de pureté HPLC et 82 % de teneur en peptide :
- Lyophilisat brut : 5,0 mg
- Peptide présent : 5,0 × 0,82 = 4,1 mg
- Dont le bon peptide : 4,1 × 0,99 = 4,06 mg
Le chiffre de 99 % de pureté est exact et l’étiquette est exacte. Ils répondent simplement à des questions différentes — la pureté demande quelle fraction du peptide présent est le bon, la teneur demande quelle fraction de la masse du flacon est du peptide.
Quand cela compte et quand non
Pour du travail qualitatif — le composé fait-il seulement ce qu’on attend — un écart de dix à vingt pour cent sur la masse réelle change rarement la conclusion.
Pour du travail quantitatif — courbes dose-réponse, détermination d’IC50, tout ce où la concentration est la variable mesurée — c’est une erreur systématique de cette taille exacte, appliquée à chaque point. Elle ne se moyenne pas avec les réplicats et ne sera pas visible dans les données.
Si l’exactitude de la concentration compte, demander la teneur en peptide. Elle vient d’un dosage distinct — analyse d’acides aminés ou dosage de l’azote — que tous les fournisseurs ne commandent pas. Savoir s’ils peuvent répondre est en soi instructif.
Tolérance de remplissage
Une seconde source de variation, plus faible. Les flacons sont remplis en masse ou en volume de solution avant lyophilisation, et ni l’un ni l’autre n’est exact. Des tolérances de quelques pour cent sont normales et ne constituent pas un défaut.
En pratique, un flacon étiqueté 5 mg peut contenir 4,9 ou 5,1 mg de lyophilisat avant même tout calcul de teneur. Pour la plupart des travaux c’est négligeable ; pour les plus précis, la réponse est la pesée, et la pesée exige une balance analytique et une manipulation au sec, pas une étiquette.
Comparer correctement les fournisseurs
Le prix par flacon est une comparaison presque dénuée de sens. Deux flacons de 10 mg au même prix sont des produits différents si l’un contient 90 % de peptide et l’autre 75 %.
La grandeur comparable est le coût par milligramme de peptide :
coût par mg de peptide = prix ÷ (masse du flacon × teneur en peptide × pureté)
La plupart des fournisseurs ne publient pas la teneur en peptide, ce qui signifie que pour la plupart des comparaisons on travaille avec deux des trois chiffres. Mieux vaut le savoir que le contourner — et c’est une raison de plus pour laquelle la disposition à répondre à une question analytique précise sépare les fournisseurs plus sûrement que leurs sites web.
Notre article teneur contre pureté détaille la distinction, l’article sur les contre-ions d’où vient la masse supplémentaire, et l’article sur les prix ce qui détermine le coût.
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