Konwencje nazewnictwa peptydów wyjaśnione
BPC-157, GHK-Cu, ipamorelina, semaglutyd, MOTS-c — sześć systemów nazewnictwa w sześciu nazwach i co każdy z nich naprawdę koduje.
Nazwy peptydów to plątanina nałożonych na siebie konwencji. BPC-157, TB-500, GHK-Cu, ipamorelina, semaglutyd, MOTS-c, SNAP-8 — sześć systemów nazewnictwa w sześciu nazwach. Każda niesie informację, gdy wiadomo, do którego systemu należy.
Nazwy fragmentów: liczba po myślniku
BPC-157, TB-500, AOD-9604. Liczba to zwykle kod laboratoryjny lub rozwojowy, a nie znacząca miara, ale wzorzec sygnalizuje związek pochodzący od większego białka macierzystego albo z nim powiązany.
BPC-157 to 15-resztowa sekwencja powiązana z białkiem żołądkowym oznaczonym jako Body Protection Compound. TB-500 odpowiada fragmentowi tymozyny beta-4. Te nazwy kodują linię badawczą, a nie strukturę — dlatego certyfikat musi potwierdzać sekwencję, a nie nazwę.
Nazwy składu: litery, które są sekwencją
GHK to glicylo-histydylo-lizyna — nazwa jest sekwencją w kodzie jednoliterowym. KPV to lizyna-prolina-walina. GHK-Cu dodaje jon miedzi, który peptyd chelatuje.
Ta konwencja działa tylko przy bardzo krótkich peptydach i właśnie tam się ją widzi. Jest też najbardziej informatywnym używanym systemem: nazwa podaje cząsteczkę.
Rdzenie farmaceutyczne: -tyd, -relina, -reliks
Światowa Organizacja Zdrowia nadaje międzynarodowe nazwy niezastrzeżone za pomocą znormalizowanych rdzeni, więc końcówka nazwy leku niesie realną informację klasyfikacyjną:
| Rdzeń | Znaczenie | Przykłady |
|---|---|---|
| -tyd | Peptyd | Semaglutyd, tyrzepatyd, liraglutyd |
| -relina | Agonista hormonu uwalniającego | Tesamorelina, ipamorelina, sermorelina |
| -reliks | Antagonista hormonu uwalniającego | Cetroreliks, degareliks |
| -glutyd | Analog GLP-1 | Semaglutyd, dulaglutyd |
| -mab | Przeciwciało monoklonalne (nie peptyd) | — |
Nazwa kończąca się na -relina mówi więc, że związek działa jako agonista receptora hormonu uwalniającego, a -reliks, że go blokuje. Ipamorelina i tesamorelina mają wspólny rdzeń mimo zupełnie różnych receptorów — rdzeń opisuje klasę funkcjonalną, nie cel.
Kody klasa plus numer
GHRP-2, GHRP-6 — growth hormone releasing peptide, numerowane według kolejności opracowania. CJC-1295 — kod firmowy ConjuChem. SNAP-8 — nazwa handlowa acetylo oktapeptydu-3, który sam jest oznaczeniem składnika kosmetycznego.
Liczby w tych nazwach nie mają znaczenia chemicznego. GHRP-6 nie jest „bardziej” niż GHRP-2.
Nazwy od pochodzenia biologicznego
MOTS-c — mitochondrial open reading frame of the twelve S rRNA type-c. DSIP — delta sleep-inducing peptide, nazwany od zaobserwowanego efektu. Epitalon — od nabłonka szyszynki, tkanki pochodzenia. Te opisują, skąd peptyd pochodzi albo co zaobserwowano najpierw, a nie czym jest.
Dlaczego ma to znaczenie praktyczne
Z dwóch powodów.
Nazwy nie są jednoznaczne. Ta sama cząsteczka występuje pod kilkoma nazwami — acetylo oktapeptyd-3, SNAP-8 i jego oznaczenie INCI to jeden związek. Porównywanie dostawców oznacza porównywanie sekwencji i mas, a nie nazw.
Nazw nie da się zweryfikować. Certyfikat potwierdzający „BPC-157″ nie potwierdza niczego, jeśli nie podaje sekwencji i masy z nią zgodnej. Nazwa to etykieta; sekwencja i masa to twierdzenie.
Nasz przewodnik po czytaniu sekwencji peptydowych omawia notację, a przewodnik po certyfikacie to, co dokument musi zawierać, by cokolwiek znaczył.
All products and information referenced are for in-vitro research and laboratory use only. Nothing here is medical advice, and no therapeutic claim is made or implied.